由于我国煤层赋存条件极其复杂，井工开采比例大，中小型矿井数量巨大，导致了我国煤炭开采技术呈多层次复杂结构，我国煤矿整体技术水平和安全生产水平还相当落后，煤炭资源洁净开发利用研究起步晚，技术不够成熟，由于大量煤炭直接燃烧而造成的环境污染还相当严重。要解决煤炭工业健康发展的一系列重大问题，必须依靠科技进步，必须依靠自主创新，必须全面提升煤炭工业的整体科学技术水平和安全生产水平。
　　煤炭工业要全面落实《国务院关于促进煤炭工业健康发展的若干意见》精神，走资源利用率高、安全有保障、经济效益好、环境污染少的新型工业化道路，必须全面落实科学发展观，必须坚决依靠科技进步。今后我国煤炭工业科学技术发展目标，要紧紧围绕大型煤炭基地建设技术、煤矿高效安全生产技术、煤炭综合加工利用技术以及矿区生态环境保护与治理技术等领域，开展综合攻关，重点突破，强化创新，引领发展，实现绿色开采，发展循环经济，使我国煤炭资源开发利用的整体技术水平有所突破，“十一五”末使科技对全行业经济发展的贡献度达到40％以上。
　　在资源勘探及矿井建设技术领域，要重点研究开发高精度、高分辨率和高可靠性的地质勘探技术装备，提高地质结构的勘探精度，为我国大型煤炭基地建设和复杂地层条件下的资源开采提供可靠的地质保障。同时开展我国中东部地区深部煤层资源赋存规律和探测与开采技术的研究，开展深部高效找矿和快速勘探技术研究，研究和解决600米以上深厚冲积层下凿井技术理论和技术难题，为我国深部煤炭资源高效、安全开采提供理论依据和技术手段。
　　在煤炭资源开采技术领域，利用现代加工技术、智能控制技术和工况监控技术，研究开发大功率、高可靠性的采煤装备，使井工开采工作面生产能力达到每年1000万吨以上，大型露天矿生产能力达到每年2000万吨以上，同时使薄煤层开采技术和短壁开采装备水平有突破性提高，使采煤装备更适合于我国各类复杂煤层的开采条件，全面提升我国采煤技术的机械化、自动化水平。
　　在煤矿安全技术研究开发领域，重点是开展煤矿安全生产长效机制的理论体系研究，研究预防重特大事故的治本之策。首先要开展煤矿瓦斯与煤尘爆炸机理与传播规律研究，进一步摸清瓦斯与煤尘爆炸的发生机理及演化过程。其次要开展瓦斯高效抽放技术装备的攻关研究，使松软低透气，性高瓦斯煤层的抽放以及地面、井下相结合的抽放技术装备取得突破性进展。再次要重点开发研究实时性强、智能化程度高、处理能力强立可靠性强的煤矿安全监测监控系统装置，对井下的瓦斯、煤尘、火灾等灾害进行适时有效的监控。与此同时，要开展各种地层条件下的水害防治技术、冲击地压防治技术和煤与瓦斯突出防治技术的攻关研究，制定矿井灾害的综合防治措施，全面提升矿井的综合安全保障能力。
　　在煤炭洁净利用和转化技术领域，要深人研究高硫煤、难选煤脱硫降灰基础理论，以简化实用工艺系统，实现高硫高灰谋炭的高精度分选，使我国煤炭洗选加工的精度和效率居世界领先水平。在煤炭加工转化方面，重点攻关煤炭直接液化和间接液化技术，取得具有自主知识产权的煤炭液化技术，并逐步为煤炭液化实现产业化提供技术保障。